ロックマン エグゼ

シーズン1

ＧＢＡ（ゲームボーイアドバンス）で発売されたゲームがアニメ化！ 現在よりも、少し先の未来。人々は、高度に電子化された社会に暮らしていた。全ての人が「ＰＥＴ」と呼ばれる携帯端末を持ち、そこに組み込まれた疑似人格型プログラム「ネットナビ」によって、日常生活のほとんどをネットワーク上で補っていた。 その一方、ネット犯罪は増加し、その中でもネット犯罪集団・ＷＷＷ（ワールドスリー）がバラまくウイルスは、人々の生活を脅かし続けていたのだ。 ある日、光熱斗（ひかりねっと）のもとに父親から届いた、１枚のＣＤーＲＯＭ。その中にはロックマンというネットナビがプログラムされていた。 最初こそロックマンに戸惑う熱斗だったが、パートナーとしてともに成長していくことになる。 ロックマンに秘められた力、熱斗の天性のウイルスバスティング能力。そして２人のかたく結ばれた友情が、ネットに潜んだ闇を暴いていく！

AXESS

科学省を訪れる熱斗とメイル。科学省では、熱斗の父・光裕一朗博士を中心に、ネットナビの三次元化の研究を行っていた。 新しく開発した、オペレーターとネットナビの融合(クロスフュージョン)を可能にするシンクロチップを使って、ディメンショナルエリアという特殊な空間にネットナビを疑似物質化する実験だ。実験が成功すれば、いつか自分たちも融合出来る・・・?と期待の目で実験を見守る熱斗とロックマン。 「クロスフュージョン!」の掛け声で、PETにシンクロチップを挿入する実験要員。 しかしネットナビと融合したのは一瞬で、すぐに分離してしまった!実験結果にがっかりの熱斗であったが、その直後科学省のメインコンピューターに大量のウィルスが侵入!破壊活動を開始するウィルス達に対し立ち向かう熱斗であったが・・。

ストリーム

熱斗、ロックマンたちの活躍によりDr.リーガルとレーザーマンは倒され、地球には平和が訪れた。だがそれも束の間、地球はさらなる危機に直面していた。リーガルの背後にいた「デューオ」という未知なる存在である。 デューオとは、彗星に偽装し、はるか遠い異星より地球に接近してきた地球外ネットナビ。その目的は宇宙を探査し、危険な惑星を見つけ抹殺することだ。リーガルの起こした事件を観測したデューオは、地球という惑星に対し「抹殺」という審判を下した。 現実世界の世界各地に多数のウイルスが実体化・巨大化し、街を破壊しはじめる。熱斗とロックマン、炎山とブルースはクロスフュージョンし、地球を襲う異変に立ち向かおうとするが、その時、熱斗たちはデューオ、そしてデューオに仕えるナビ、スラーと邂逅する。デューオは、人間とナビの融合、クロスフュージョンに興味を持ち、地球の未来を見届けたいと考えた。 デューオは地球抹殺の前に人類に試練を与える、と言う。 地球抹殺を回避したければ、その試練を乗り越えよ、というのだ。人類には猶予が与えられたのである。 デューオの試練とは一体何なのか。スラーが人々へ与える悪の芽、アステロイドとは何者なのか。熱斗たちの、地球と、サイバーワールドを救うための戦いは始まったばかりである。

ビースト

各地の電脳世界では異常な温暖化現象が確認され始めた。その影響で氷漬けから解かれたバブルマンは、謎の赤ん坊ナビを発見、さらに電脳世界にできた光の裂け目と、その奥に広がる異世界（＝ビヨンダード）で暴れる数々のウイルスの姿を目撃する。 一方、現実世界では、半実体化した2体の電脳獣グレイガとファルザーが出現、争いながら街を破壊し始めた。ネットセイバー光熱斗、炎山、ライカは、クロスフュージョンで立ち向かうが歯が立たない。 そして電脳世界に戻って暴れ続ける2体にロックマン、ブルース、サーチマンが絶体絶命となったその時、謎の赤ん坊ナビがロックマンと融合、獣の姿へと変貌したロックマンは超絶な力を発揮し2体の電脳獣を一蹴する。この出来事をきっかけに、獣化したウイルスやゾアノロイドと名乗る者達による謎の事件が多発し始めるのだった。 果たしてビヨンダードとはどんな世界なのか？2体の電脳獣、ゾアノロイドらの目的は何か？謎の赤ん坊ナビの正体は？そして獣化したロックマンにはどんな秘密が？渦巻く数々の謎の中、熱斗とロックマンの新たなる戦いが始まった！！

ビーストプラス

グレイガとファルザーとの闘いを終え、ビヨンダードから帰還した熱斗達は、これまでの 生活を取り戻し平穏な日常を過ごしていた。 が、それも束の間。ほどなくして植物状の電子データが実体化し、はびこるという奇怪な 事件が発生。 さらに獣化ウイルスが実体化し人々を襲うという事態に発展する。 熱斗はクロスフュージョンして獣化ウイルスを倒すが、そこに一体のナビらしき人影が 現れる。 その人影の正体とは？そして、明らかになる驚くべき計画とは？ 新たな敵に熱斗とロックマンが立ち向かう！